تقع بحيرة التمساح شمال جمهورية مصر العربية في مدينة الإسماعيلية، الواقعة على شمال ضفتها، وتعدّ من أهمّ البحيرات الأربع التي تمرّ قناة السويس من خلالها، وتأتي بعد بحيرة المنزلة من الشمال الى الجنوب.
وترتيب البحيرات على النحو الآتي من الشمال إلى الجنوب: بحيرة المنزله، وبحيرة التمساح، والبحيرة المرة الكبرى، والبحيرة المرة الصغرى. في الواقع لا يبلغ عمق البحيرة أكثر من متر واحد تقريباً في معظم الأحيان، وهو عمق ضئيل جداً مقارنة بالبحيرات الثلاث الأخرى، وتبلغ مساحتها حوالي 14 كم2.
تعد القناة التي حُفِرت في عهد الملك سنوسيرت التالت أيّام المملكة الوسطانيه قبل حوالي 4000 عام، أوّل قناة تمرّ في البحيرة، وقد أعادوا حفرها مرّات عديدة، حيث أعيد حفرها وتوسيعها سنة 600 ق.م، على عهد الملك نيخاو الثاني، وكان آخر عملية حفر لها على أيام الخليفة العباسي المنصور. أخذ فرديناد ديليسبس تصريحاً من الخديوي بحفر قناة السويس لتمرّ هي الأخرى بالبحيرة.